Casos de un detective que vuelve a la preadolescencia por el uso de químicos.
Episodio 1
1. Asesinato en la montaña rusa
Shinichi resuelve un asesinato y persigue a dos hombres misteriosos que le envenenan haciendo que encoja hasta el tamaño de un niño de siete años.
Episodio 2
2. El secuestro de la hija del presidente
Shinichi pide ayuda a su amigo el profesor Agasa para ocultar su verdadera identidad bajo el nombre de Conan Edogawa.
Episodio 3
3. El caso de la habitación cerrada
El Dr. Agasa le da un cambiador de voz a Conan para que ayude a Mouri entre bastidores.
Episodio 4
4. El pez brillante
Conan y sus amigos encuentran un trozo de papel con la palabra "ORO" escrita en él. Siguiendo las pistas intentarán encontrar un tesoro.
Episodio 5
5. La gran explosión del tren bala
Conan y sus amigos acompañan a Kogoro en el tren. En el trayecto se encuentran con dos hombres que llevan una bomba.
Episodio 6
6. El asesinato del día de San Valentín
Ran es invitada a una fiesta el día de San Valentín. Conan se pone celoso y decide ir también.
Episodio 7
7. La amenaza del regalo mensual
El cirujano Masayuki Ogawa necesita ayuda y Kogoro se hace cargo del caso, como siempre con Conan investigando.
Episodio 8
8. Asesinato en el museo de arte
Ran obliga a Conan y Kogoro a visitar el museo de arte de Beika. El museo será demolido pronto, pero ocurre un asesinato.
Episodio 9
9. Asesinato en el festival
En la noche del Festival de Primavera Conan y los demás se encuentran con Sasai. Sasai les pide que le hagan una foto.
Episodio 10
10. El caso del chantaje al jugador de fútbol
Una chica joven llega a la oficina de Kogoro para pedirle que encuentre a su novio desaparecido: Shinichi Kudo.
Episodio 11
11. Sonata a la luz de la luna ( I parte)
Kogoro recibe una carta de Seiji Aso en la que se anuncia un asesinato.
Episodio 12
12. Sonata a la luz de la luna (II parte)
Tras releer la carta, Conan cae en la cuenta de que lo que la carta anuncia realmente son asesinatos en serie, por lo que aún no ha acabado.